Roberto A. Ribas Zunino / Investigación / MetaVision3D: el metaboloma cerebral en 3D
Co-primer autor · Nature Metabolism · 2025
MetaVision3D: el metaboloma cerebral en 3D
Un artículo en Nature Metabolism como co-primer autor que lleva la metabolómica espacial de cortes planos a un atlas 3D del metaboloma cerebral.
El problema
La metabolómica espacial revela una complejidad enorme en un solo corte 2D, pero los tejidos son tridimensionales. Apilar cortes seriados en un modelo 3D fiel es difícil: cada corte se obtiene, monta y mide de forma ligeramente distinta.
Qué hace el flujo de análisis
MetaVision3D usa visión por computadora para transformar secciones seriadas de imagen por espectrometría de masas MALDI 2D en un metaboloma espacial 3D de alta resolución. Alinea las secciones automáticamente (MetaAlign3D), normaliza la variación de señal entre cortes (MetaNorm3D), rellena huecos en cortes dañados (MetaImpute3D) e interpola entre secciones (MetaInterp3D) para generar un modelo 3D continuo.
Como prueba de concepto, el equipo construyó un atlas 3D del metaboloma del cerebro de ratón en animales sanos y enfermos, publicado como servidor web interactivo y abierto.
Por qué importa
Permite a quienes investigan el metabolismo cerebral ver dónde se ubican las moléculas a lo largo de estructuras completas, no solo en un plano, y consultar un atlas abierto. UF Health difundió el trabajo al publicarse.
Mi papel
Uno de los cuatro co-primeros autores (contribución equivalente). A partir de este trabajo desarrollé Vision (herramienta interna, aún no publicada), una plataforma integral que combina Sami (Spatial Augmented Multiomics Interface, Nat Commun 2025) y MetaVision3D para el análisis, la visualización y el agrupamiento UMAP espacial de datos ómicos espaciales de alta dimensión.